DAP-seq技术流程

DAP-seq(DNA affinity purification sequencing)是通过体外合成蛋白的方式快速识别转录因子结合位点相比ChIP-seq这种传统方法DAP-seq完全不需要抗体并且实验时间更短。对构建转录因子调控网络方面具有很好的应用前景。实验流程1基因组DNA文库准备2转录因子蛋白体外表达3转录因子蛋白亲和纯化目标DNA4DNA文库构建5二代测序。数据分析流程1测序数据质控2与参考序列比对3Peak calling统计样品Peak信息峰检测及计数、平均峰长度、峰长中位数4统计样品Uniquely mapped reads在基因上、基因间区的分布情况及覆盖深度5给出每个样品Peak关联基因列表及GO和KEGG功能注释5在多个样品间对Peak进行差异分析。应用领域1转录因子结合位点研究2重塑因子结合位点研究技术优势