微生物群落组装机制

• 微生物群落组装机制

两种生态过程理论（基于生态位过程理论和中性过程理论）共同描述微生物群落形成（组装）机制。

生态位理论假设物种特征、物种间相互作用和环境条件等确定性因素控制着群落结构和代谢功能。即微生物群落是由确定性的生物因素（物种相互作用，如竞争、捕食）和非生物因素（环境因素，如pH、温度）形成的，这是由微生物不同的栖息地偏好和适应性造成的。

中性过程理论假设微生物在类群的丧失（loss）和增加（gain）表现出随机平衡，即随机过程（出生birth、死亡death、迁移immigration、物种形成speciation、扩散限制limited dispersal）塑造了微生物群落结构。

即微生物群落组装（形成）/群落结构由确定性和随机性生态过程共同塑造。

基于i CAMP模型的不同生物炭添加比例人工湿地微生物群落组装过程

为探究不同生物炭添加比例下人工湿地微生物群落组装的生态学机制,本文采用i CAMP模型来量化不同生态过程,包括异质性选择(HeS)、同质性选择(HoS)、扩散限制(DL)、同质化扩散(HD)和漂移(DR)对群落构建的贡献[13].iCAMP结果显示,生物炭的添加显著改变了微生物群落不同生态过程的相对重要性(P<0.01),其中,漂移和同质性选择比其他过程占比更大,相对重要性分别为32.4%～43.7%和41.8%～51.9%(图11),这两种过程是本文后续分析的重点.

根据iCAMP采用的零模型原理,同质性选择和异质性选择被认为是确定性过程(Determinism),而扩散限制、同质化扩散和漂移被认为是随机性过程(Stochasticity)[13],其中,同质性选择和异质性选择的相对重要性总和可以用来评估微生物群落构建的确定性,扩散限制、同质化扩散和漂移的相对重要性总和用来评估微生物群落构建的随机性[13].A quantitative framework reveals ecological drivers of grassland microbial community assembly in response to warming | Nature Communications

群落组装机制综述（周集中和宁大亮-MMBR）：科学网—iCAMP学习4--群落组装机制综述（周集中和宁大亮-MMBR） - 杨志远的博文 (sciencenet.cn)

Nat. Rev. Microbiol.：微生物群落形成过程中的优先效应：重磅综述 | Nat. Rev. Microbiol.：微生物群落形成过程中的优先效应|微生物|群落|效应|优先|宿主|-健康界 (cn-healthcare.com)

⭐微生物群落组装过程（assembly processes）-CSDN博客

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